来到南京后，不时能听见有关王昆仑和他夫人曹孟君与共产党之间关系的传闻。随着内战局势的日益明朗，王昆仑在国民党内的处境也日见艰难。只是碍于没有证据，再加上王昆仑与孙科等人关系特殊，国民党CC派才没有急于动手。

这种局面一直维持到了1947年冬。这天，王昆仑获知，CC系终于决定对自己及曹孟君下手了，他立即借着养病的名义住进了上海虹桥疗养院，并写信给蒋介石要求出国治病。在信中，王昆仑提出了两点要求：一，请求发给护照；二，请给予外汇。黄苗子正好和委员长侍从室的一位副主任熟识，他找到这位副主任说：孙科、吴铁成对王昆仑很关心，他想出国治病，请你帮个忙。副主任也明白王昆仑是孙科的太子派人物，便批准了王昆仑的出国护照。黄苗子再次找他商量，终于又为王昆仑争取到了一千元美金。

1948年3月10日，黄苗子夫妇收到了王昆仑从美国纽约寄来的明信片。安全出逃的王昆仑对置身其中的这座国际都市并没有太多好感，他在信中写道：

告诉你们，我就住在这看一眼便使人心乱如麻的世界第一大城市里，幸亏我是一个病人，居然做到‘万人如海一身闲’的境地……”信外附诗一首：“蚁穴蜂巢地，乌烟瘴气天，满街泥拌血，盖世腿和钱；杜鲁门将闭，华来士渐添。高楼衔小月，人说此邦圆。

1948年5月，俞鸿钧调任中央银行总裁，同年8月，黄苗子也被调往中央银行，担任秘书处副处长，负责总裁室事务。年底，解放军开始向长江一线进逼。9月12日发起辽沈战役，东北全境获得解放；11月6日发动淮海战役，长江以北的华东、中原地区基本获得解放；11月29日发起平津战役，华北地区除太原、大同、新乡等少数据点及绥远西部一隅之地外，全部获得解放。在国共两党的这场角逐中，谁将成为最终的执牛耳者，趋势已经很明朗。

11月，郁风带着两个孩子，悄悄去了香港。从表面上看，她是送两个孩子去探视祖母，实质上，她是有意想将孩子留在香港，以便能够从容面对暴风雨的前夜，甩开胳膊大干一场。在香港中环最豪华的吉罗斯大酒店，她见到了夏衍和潘汉年。郁风询问，一旦解放军横渡长江，自己这些外围人士该有哪些行动？潘汉年平静地谈到了解放军进城后的政策，嘱咐郁风和黄苗子原地待命、静候解放。他说，让黄苗子注意保存档案，尽可能保住国库，并委托郁风到上海后，带个口信给地下党员、企业家蔡叔厚，让他尽快对上海警备司令汤恩伯进行策反。

一周后，郁风到了上海。在和黄苗子通电话时，黄苗子的语气有些异常，让她暂时不要回南京。郁风立刻领悟到南京那边出了问题。她没有多问，而是在租界的母亲家中住了下来。

又过了一个星期，黄苗子再次打来电话，告诉郁风说可以回家了。原来，郁风去香港的事情被国民党CC系特务察觉，他们放出消息说郁风是和共产党接头去了。消息一经散布，黄苗子在国民党内的局面便显得极为被动。特务此举，目的之一也是为了打击吴铁成派。

黄苗子动用各种关系进行了疏通。郁风回到南京后，原先散布流言的特务头目亲自出面请郁风吃饭，表示欢迎她省亲归来。一场惊险就此揭过。

没过多久，黄苗子被调往上海中央信托局秘书处担任处长。举家搬迁到上海后，他便和郁风一起，遵照夏衍等人的叮嘱，静静地等待解放时刻的到来。